测序标准实验室设计二代测序实验室布局分区建设要求上海西递

上海西递实业有限公司为您提供测序标准实验室设计二代测序实验室布局分区建设要求上海西递。一、二代基因测序实验室的发展与应用二代基因测序（next-generation sequencing，ngs）技术，主要应用于-检测，如遗传-、实体-、--、-性-、人类白细胞抗原分析及非侵袭性产前-等。-有关学会已-相关共识与指南以推动其在-中的应用。二代基因测序技术的发展对测序数据的处理分析提出了-的要求。目-代基因测序实验室建设数据分析软件很多，但是绝大多数软件仅能完成单一的分析功能，如何能正确gao效地选择整合这些软件已成为迫切需求。saren对于二代基因测序实验室建设已经有所研究。三仁-开发设计了一套基于二代基因测序-的实验室建设方案，wan美的实验设计原理，一站式建设和规划方案，简化了数据分析过程中的人工操作，-提高了运行效率。二、二代测序（ngs）实验室装修设计之布局分区1. 原则上ngs实验室应当分为分区：样本前处理区、试剂储存和准备区、样本制备区、-制备区、杂交捕获区/多重pcr区域（一扩增区）、-扩增区（二扩增区）、-检测与质控区、测序区、数据存贮区。2.各工作区的空气和人员流向应按照<-机构-基因扩增检验实验室工作导则>的要求来设计。3. 实际设计中的布局分区可根据实际情况合并，通常由建设方提出要求，或实验室装修设计公司给出建议、由双方协商决定。但是在前处理和建库时，-样本应与组织样本分开。三、二代测序（ngs）实验室的建设要求1．ngs检测人员的-要求：ngs检测-应具备-病理学、分子生物学的相关大专以上-，并经过ngs技术的理论与技能培训合格。数据分析人员应具有-医学或分子生物学或遗传学知识背景并经生物信息学培训。zui终报告应由中级或硕士以上具有病理学背景、经培训合格的本单位执业-或者授权签字人(医学博士-或gao级-)审核。2．ngs检测试剂及项目要求：试剂和测序平台均应选择食品--管理-(cfda)-产品。涉及到实验室自配试剂，应该有严格的试剂制备标准操作规程（sop），需经过-实验室自建项目(ldt)验证合格才可使用。每个ngs检测项目在验证时需要根据建库方法、测序平台和分析工具以及不同的突变类型包括，单碱基突变single nucleotidevariant，snvs、小片段插入或者缺失（indels）、基因拷贝数变异copynumber variations（cnvs）、染色体结构变异，structuralvariation（svs）以及不同的样本类型（如ffpe组织、新鲜组织、全血、胸水等）对特定panel的准确性、-性、敏感性、特-等性能参数进行ldt验证。应该有经过标准品测试的在不同的mutant allele frequencies（maf）下，不同测序-的灵敏度及特-数据，确定不同样本的可信的测序-。经验证后，sop发生的任何改动，包括试剂、仪器、基因项目等都需要重新做验证。验证实验结果签名留底备案。3．ngs检测实验室的管理要求：ngs检测主要包括实验操作和生物信息学分析两部分。实验操作部分包括样本准备、-制备、编码（barcoding）、目标区域富集、测序等；生物信息学分析部分包括定位（mapping）、比对、变异识别、变异注释、变异-及报告等。上述流程均需要建立实验室管理体系文件和sop及机器运行和维护sop，具有严格的室内质控措施；定期参加室间质评以有及持续的-和改进计划。

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